O projekte
Projekt Trisomy IQ predstavuje komplexnú iniciatívu zameranú na zásadnú modernizáciu laboratórnych procesov a dátovej analytiky v oblasti neinvazívneho prenatálneho testovania (NIPT). Spoločnosť TRISOMYtest, s.r.o., ako poskytovateľ NIPT služieb s najvyšším podielom na trhu neinvazívnych prenatálnych skríningových testov analyzujúcich DNA na Slovensku, disponuje silným zázemím a odbornou kapacitou na realizáciu projektu, ktorý reflektuje aktuálne požiadavky výzvy – najmä v oblastiach robotizácie, automatizácie, digitalizácie a využívania inteligentných technológií v zdravotníctve.
Jadro projektu spočíva v:
a) dizajnu automatizácie kľúčových laboratórnych krokov, konkrétne izolácie DNA a prípravy genomických knižníc, ktoré sú doposiaľ vo veľkej miere vykonávané manuálne.
b) optimalizácii a validácii využitia robotických systémov, ktoré umožní výrazné zníženie rizika ľudskej chyby, zvýšenie konzistencie výstupov, štandardizáciu procesov a optimalizáciu časovo náročných činností, všetko v rámci nadväznosti na akreditáciu a certifikáciu laboratórnych činností v prostredí príslušných ISO noriem aj s presahom na IVD-R legislatívu. Automatizácia zároveň zvyšuje kapacitu laboratória bez nevyhnutnosti navýšenia personálnych zdrojov, čím sa vytvára priestor na kvalifikovanejšie využitie pracovníkov v analytických a kontrolných fázach skríningu a následnej diagnostiky.
c) digitalizácii spracovania klinických a genomických dát. V tomto smere bude implementovaný analytický softvérový nástroj KNIME, ktorý poskytuje široké možnosti správy, analýzy, vizualizácie a archivácie ako laboratórnych tak aj štatisticky relevantných dát, vrátane ich priebežného aj kumulatívneho štatistického spracovania ako súčasť novej generácie IQ/OQ/PQ procesov s priamou možnosťou využitia nielen v domovských ale aj externých kooperujúcich laboratóriách používajúcich metodiku Trisomy test formou technologického transferu v zahraničí. KNIME zároveň umožňuje integráciu prvkov strojového učenia, umelej inteligencie aj v optimalizáciu rozhodovacích stromov, čím sa zásadne rozširuje schopnosť systému analyzovať, hodnotiť a interpretovať diagnostické dáta v kontexte personalizovanej medicíny. Softvérová integrácia KNIME s existujúcimi systémami LIMS (LisApp) zabezpečí plnú trasovateľnosť vzoriek, automatizované reportovanie a zjednotenú dátovú architektúru v laboratóriu.
Z hľadiska technologickej pripravenosti dosahujú navrhované riešenia úroveň TRL 5 a vyššie, pričom robotické zariadenia sú validované v relevantných laboratórnych podmienkach a softvérové platformy sú dostupné na komerčnej báze. Projekt má vysokú mieru technickej zrelosti a jeho implementácia je plánovaná v reálnych podmienkach etablovaného laboratória.
Projekt sa vyznačuje výrazným presahom nad rámec bežne dostupných riešení. Kombinácia robotizácie a dátovej inteligencie vytvára nové štandardy v oblasti spracovania biologických vzoriek a relevantných klinických a anamnestických dát. Využitie princípov otvorenej vedy, najmä prostredníctvom dokumentovateľných workflowov a FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) dátovej architektúry, zabezpečuje transparentnosť, reproducibilitu a potenciál zdieľania výstupov v rámci širšej výskumnej komunity.